においチェッカーで、肌に密着させて測定する場合と服の上から測定する場合で、違いはありますか？

違いはあります。
服の上からはかると、服のにおいも一緒にはかってしまう可能性があるので、からだのにおいを測定する場合は測定部を肌に密着させて測定してください。肌に密着させて測定する際は、水で湿らせ固く絞った柔らかい布で、測定部を拭いてください。